Болденон можа ператварацца ў эстраген, але менш, чым у тэстастэрон, акрамя таго, болденон метаболізіруется ў 1,4 дыендион, які з'яўляецца магутным інгібітараў ароматазы.Болденон ператвараецца з дапамогай 5-альфа-редуктазы ў 1-тэстастэрон, больш магутны стэроід, а таксама ў 5-бэта-ізамер, які лічыцца неактыўным метабалітам.Звязванне з SHBG значна ніжэй з болденоном, чым з тэстастэрону, што азначае большую канцэнтрацыю свабоднай плазмы, але меншы перыяд паўраспаду ў плазме.Звязванне з рэцэптарамі прогестерона або глюкакартыкоідаў практычна адсутнічае, а рэальных дадзеных аб узаемадзеянні болденона з рознымі ферментнымі сістэмамі няма.

Болденон дзейнічае падобна метандростенолону з меншай колькасцю негатыўных андрогенных эфектаў.Ён мае вельмі доўгі перыяд паўраспаду і можа выяўляцца ў тэстах на стэроіды да 5 месяцаў з-за доўгага ундециленатного эфіру, далучанага да зыходнага стэроіда.Сляды прэпарата можна лёгка выявіць на працягу некалькіх месяцаў пасля спынення выкарыстання.
Нягледзячы на ​​тое, што звычайна параўноўваюць з нандролон, у болденона адсутнічае ўзаемадзеянне з рэцэптарамі прогестерона і ўсе звязаныя з ім прогестагенные пабочныя эфекты.